Su fundación fue el 28 de septiembre de 1991 a raíz de la fusión de los equipos AD Pérez Zeledón y ADM Generaleña.
El mayor logro deportivo del conjunto generaleño ha sido el título conseguido en el Torneo de Apertura 2017 tras derrotar en la final al Club Sport Herediano.
Pérez Zeledón es uno de los pocos equipos que nunca han descendido.
Aquí hacemos un repaso de datos históricos presentados por el periodista y estadígrafo Gerardo Coto Cover.
Nombre: AD Municipal Pérez Zeledón
Fundación: 28 de setiembre de 1991
Títulos: Campeón Nacional en Apertura 2017; Monarca de Tercera División en 1984 (antes de la fusión), de Segunda División en 1991.
Rendimiento en primera: 1334 juegos; 432 victorias, 383 empates y 519 derrotas; 1656 goles anotados y 1838 recibidos
Debut en primera: 05/01/1992 M. Puntarenas 1 Pérez Zeledón 1
Máximo goleador: Taylor Morales (85)
Con más juegos: Taylor Morales (445)
Técnicos en primera: 34
Con más juegos dirigidos: Juan J. Gámez (206)
Con más victorias: Juan J. Gámez-José Giacone (Argentino), 59
Técnicos extranjeros: 16
Top10 de máximos goleadores:
1. Taylor Morales, 85
2. Fárlem Ilama, 71
3. Keilor Soto, 63
4. Luis S. Pérez, 55
5. Wílberth Pérez, 43
6. Diego País (Argentino), 41
7. Michell Myers, 39
8. Marvin Chinchilla, 38
9. Freddy Fernández, 32
10. Josué Mitchell, 28
Top10 de jugadores con más partidos en primera:
1. Taylor Morales, 445
2. Freddy Fernández, 384
3. Luis S. Pérez, 383
4. Geiner Segura, 365
5. Luis Carlos Barrantes, 296
6. Keilor Soto, 251
7. Juan C. Gamboa, 232
8. Fárlem Ilama, 225
9. Wílberth Pérez, 225
10. Juan D. Monge, 218
